Pengangkutan utama di Kota Bharu adalah bas. Syarikat Kenderaan Melayu Kelantan (SKMK) telah menyediakan perkhidmatan bas bandar dengan bayaran mengikut zon-zon yang ingin dituju. Stesen bas bandar di Kota Bharu Bandar Raya Islam terdapat di dua lokasi iaitu di Jalan Pendek dan berdekatan dengan Masjid Muhammadi berdekatan dengan Kampung Kraftangan.

Terdapatan sebuah lapangan terbang di Kota Bharu iaitu Lapangan Terbang Sultan Ismail Petra yang ditempatkan di Pengkalan Chepa.

Lebuhraya Rakyat adalah jalan terancang untuk menyambung Kota Bharu ke bandar jajahan Kuala Krai.